Análisis de Datos Espaciales en Salud Pública con R

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Información General

Programa XXVIII Escuela Internacional de Verano 2027
Año 2027
Semestre Primero
Nombre Análisis de Datos Espaciales en Salud Pública con R
Nombre Convenio Marco
Equipo coordinador Encargado: Sandra Flores Alvarado
Coordinador: Sandra Flores Alvarado
Administrativo: Catherine Sanhueza Cordero

Equipo docente
  • Sandra Flores Alvarado
Académicos Externos
  • Ismael Bravo Rodríguez - Centro de Investigación en Vigilancia, Epidemiología y Nuevas Tecnologías para Amenazas Infecciosas Emergentes (SENTINET); Escuela de Salud Pública y College, Pontifica Universidad Católica de Chile;⁠ Laboratorio de Epidemiología Espacial (LESP); ⁠Centro de Ciencia del Clima y la Resiliencia (CR2)
  • José Daniel Conejeros Pavez - National Center of Excellence for Research and Development SENTINET (Surveillance, Epidemiology and New Technologies for Infectious Emerging Threats); ISI Foundation, Turin, Italy; Escuela de Gobierno. Pontificia Universidad Católica, Santiago, Chile.
Ayudantes Alumnos
  • Francisca Vásquez Estay
Unidad académica Programa de Bioestadística
Versión 1
Modalidad Presencial
Tipo de Curso Educación Continua
Créditos 30 0
Horas del Programa Horas directas (sincrónicas y asincrónicas): 20
Horas indirectas: 10
Días y Horarios Lunes a viernes 9:00 a 13:00 horas.
Lugar
Cupo alumnos mínimo 6
Cupo alumnos máximo 30
Competencias y Habilidades
necesarias para la Asignatura (Pre-requisitos)


Manejo básico de R y RStudio (u otro IDE): carga de datos, manejo de objetos y uso de funciones simples. No es necesario tener el software instalado si se trabaja en los computadores de la ESP, pero quienes usen equipo propio deben traerlo instalado previamente. Se requieren además nociones básicas de epidemiología y estadística, así como conocimientos en métodos y diseños cuantitativos. Es deseable, aunque no obligatorio, contar con un conjunto de datos propio con una variable espacial de interés laboral, académico o personal para utilizarlo en la tarea del curso (de no contar con uno, el equipo docente puede proporcionarlo).

Arancel $
Duración (semanas) 1
Fecha Inicio 18/01/2027
Fecha Término 22/01/2027

Características del Curso

Área Temática

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Fundamentos

El análisis espacial permite responder preguntas centrales en salud pública: dónde se concentra el riesgo, si esa concentración es estadísticamente significativa y cómo se distribuye en el territorio. Este curso ofrece una introducción aplicada y reproducible a los métodos de estadística espacial, orientada a procesar datos georreferenciados de salud, describir patrones geográficos, identificar clusters y modelar exposición y riesgo en el territorio utilizando R. A partir de una base conceptual común sobre datos espaciales, sistemas de referencia y su uso en el contexto chileno, el curso profundiza en los dos grandes enfoques del análisis espacial en salud pública: los datos de área (tasas, autocorrelación espacial y modelos de mapeo de enfermedades) y los datos geoestadísticos (variogramas e interpolación espacial). Cada sesión combina teoría breve con talleres guiados sobre datos reales de salud, de modo que los y las participantes puedan aplicar directamente lo aprendido a sus propios proyectos.

Objetivo General

Aplicar métodos de estadística espacial en R para el análisis de datos georreferenciados de salud pública, con el fin de describir patrones geográficos, evaluar la significancia de la autocorrelación espacial, identificar clusters de riesgo y modelar la exposición y el riesgo en el territorio como insumo para la toma de decisiones.

Objetivos Específicos

  • Calcular tasas y medidas de autocorrelación espacial global (índices de Moran y Geary) para describir la distribución de eventos de salud en datos de área.
  • Estimar superficies continuas de exposición o riesgo ambiental mediante métodos de interpolación espacial (IDW y kriging) a partir de datos geoestadísticos.
  • Identificar clusters espaciales de riesgo (hotspots y coldspots) mediante autocorrelación local (LISA) y ajustar modelos de mapeo de enfermedades (CAR/ICAR/SAR/BYM).
  • Procesar, transformar y visualizar datos espaciales en R utilizando el ecosistema sf/terra/tmap, incorporando fuentes de datos abiertos y de salud disponibles en Chile.
  • Reconocer la estructura de los datos espaciales (vectoriales y raster), los sistemas de referencia (CRS) y los principales enfoques del análisis espacial en salud pública.

Contenidos/Temas

• Estructura de datos espaciales (vectoriales y raster) y sistemas de referencia (CRS), con énfasis en su uso en Chile
• Procesamiento con el ecosistema sf/terra/tmap
• Datos de área: tasas y estandarización, matrices de vecindad, autocorrelación global (Moran, Geary) y local (LISA), detección de clusters y modelos de mapeo de enfermedades (CAR/BYM)
• Datos geoestadísticos: variograma, IDW y kriging para estimar superficies continuas de exposición

Destinatarios

Profesionales, investigadores/as y estudiantes de posgrado que trabajan con datos de salud georreferenciados y que requieran incorporar métodos estadísticos espaciales a su análisis: epidemiología, bioestadística, salud ambiental, vigilancia, geografía de la salud y áreas afines.

Metodología

El curso combina clases teóricas y sesiones prácticas aplicadas en R. La primera sesión es teórica y entrega las bases conceptuales del análisis espacial en salud. Las cuatro sesiones siguientes son teórico-prácticas: cada una combina una breve exposición de contenidos con un taller guiado en R sobre datos reales de salud, de modo que los y las participantes practiquen directamente las técnicas revisadas y puedan proyectarlas hacia su propio trabajo.

La evaluación consiste en un breve proyecto de análisis espacial aplicado a datos propios de cada participante (o a datos proporcionados por el equipo docente en caso de no contar con ellos), en el que se apliquen los contenidos revisados durante el curso. Dado que durante las sesiones se entregarán los códigos de todos los análisis trabajados, la tarea consiste en replicarlos y adaptarlos al proyecto propio. La entrega final es un script reproducible (idealmente en Quarto o R Markdown) y podrá enviarse hasta el viernes 22 de enero de 2027.

La asistencia mínima para aprobar es de 4 de 5 sesiones, aunque se recomienda asistencia completa dado que el curso corresponde a un proceso de aprendizaje acumulativo.

Formas de Evaluación

  • Este curso es evaluado
  • Trabajo grupal

Calendario

Sesión Fecha Hora Docentes Contenidos Modalidad Actividad
18 enero 2027 9:00 - 13:00 Sandra Flores Alvarado
Ismael Bravo Rodríguez
José Daniel Conejeros Pavez
Conceptos básicos del análisis de datos espacial en salud: información geoespacial, autocorrelación espacial, tipos de datos espaciales (vectoriales/raster), CRS, MAUP, enfoques de análisis espacial Presencial Clase
19 enero 2027 9:00 - 13:00 Sandra Flores Alvarado
Ismael Bravo Rodríguez
José Daniel Conejeros Pavez
Procesamiento de datos espaciales: ecosistema sf/terra/tmap/stars, lectura/escritura de datos, CRS en Chile, uniones espaciales, visualización básica en salud Presencial Clase
20 enero 2027 9:00 - 13:00 Sandra Flores Alvarado
Ismael Bravo Rodríguez
José Daniel Conejeros Pavez
Análisis espacial con datos de área: tasas y estandarización, falacia ecológica, mapas coropléticos, matrices de vecindad, índices de Moran y Geary Presencial Clase
21 enero 2027 9:00 - 13:00 Sandra Flores Alvarado
Ismael Bravo Rodríguez
José Daniel Conejeros Pavez
Análisis espacial con datos de área II: autocorrelación local (LISA), clusters de enfermedades, modelos CAR/ICAR/SAR y BYM Presencial Clase
22 enero 2027 9:00 - 13:00 Sandra Flores Alvarado
Ismael Bravo Rodríguez
José Daniel Conejeros Pavez
Análisis espacial con datos geoestadísticos: variable regionalizada, variograma, IDW y kriging, aplicaciones en salud ambiental Presencial Clase

Bibliografía

Tipo lectura Tipo contenido Referencia Archivos
Básica/Obligatoria Libro Moraga, Paula. (2024). Spatial Statistics for Data Science: Theory and Practice with R. Chapman & Hall/CRC Data Science Series. ISBN 9781032633510. https://www.paulamoraga.com/book-spatial/

Recursos de Plataforma

  • Utilización de Plataforma
  • Recepción de Trabajos
  • Zoom (clases sincrónicas)
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